Bound quality string extraction for deletions
Bound quality string extraction for deletions

Unchecked, this logic will cause failures when deletion alleles lie near
the ends of reads.  This prevents such a result.

gkno/freebayes,gkno/freebayes,nh13/freebayes,ekg/freebayes,ekg/freebayes,nh13/freebayes,ekg/freebayes,nh13/freebayes,nh13/freebayes,gkno/freebayes,godotgildor/freebayes,gkno/freebayes,ekg/freebayes,godotgildor/freebayes,ekg/freebayes,godotgildor/freebayes,nh13/freebayes,gkno/freebayes,godotgildor/freebayes,godotgildor/freebayes