r-modules: Fix h5 and rhdf5
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and some packages that depend on them.

NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,SymbiFlow/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs