pythonPackages.env: make compatible with click 8
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Also clean up inputs and define checkPhase.

NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs,NixOS/nixpkgs