Update gen_ref_doc.py
Update gen_ref_doc.py

Update gen_ref_doc to take separate header files for C++, DotNet, and Java.
google/or-tools,google/or-tools,or-tools/or-tools,or-tools/or-tools,google/or-tools,or-tools/or-tools,google/or-tools,or-tools/or-tools,or-tools/or-tools,google/or-tools,or-tools/or-tools,google/or-tools