fix notebooks
fix notebooks

mdtraj/mdtraj,hainm/mdtraj,msultan/mdtraj,swails/mdtraj,gph82/mdtraj,mattwthompson/mdtraj,daviddesancho/mdtraj,gph82/mdtraj,mattwthompson/mdtraj,mattwthompson/mdtraj,kyleabeauchamp/mdtraj,mdtraj/mdtraj,mpharrigan/mdtraj,tcmoore3/mdtraj,jchodera/mdtraj,mpharrigan/mdtraj,ctk3b/mdtraj,mpharrigan/mdtraj,casawa/mdtraj,mdtraj/mdtraj,msultan/mdtraj,mattwthompson/mdtraj,kyleabeauchamp/mdtraj,jchodera/mdtraj,mpharrigan/mdtraj,ctk3b/mdtraj,casawa/mdtraj,leeping/mdtraj,tcmoore3/mdtraj,swails/mdtraj,daviddesancho/mdtraj,kyleabeauchamp/mdtraj,tcmoore3/mdtraj,hainm/mdtraj,daviddesancho/mdtraj,msultan/mdtraj,daviddesancho/mdtraj,ctk3b/mdtraj,rmcgibbo/mdtraj,tcmoore3/mdtraj,msultan/mdtraj,rmcgibbo/mdtraj,dwhswenson/mdtraj,ctk3b/mdtraj,hainm/mdtraj,rmcgibbo/mdtraj,casawa/mdtraj,swails/mdtraj,casawa/mdtraj,swails/mdtraj,daviddesancho/mdtraj,mpharrigan/mdtraj,leeping/mdtraj,ctk3b/mdtraj,jchodera/mdtraj,dwhswenson/mdtraj,jchodera/mdtraj,kyleabeauchamp/mdtraj,dwhswenson/mdtraj,kyleabeauchamp/mdtraj,casawa/mdtraj,swails/mdtraj,hainm/mdtraj,gph82/mdtraj,leeping/mdtraj,leeping/mdtraj,hainm/mdtraj