Added all method parameters to be documented.
Added all method parameters to be documented.

copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,jonasfoe/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI,copasi/COPASI,copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI,jonasfoe/COPASI,copasi/COPASI