add cluster attribute to Atoms and refactor input file generation
add cluster attribute to Atoms and refactor input file generation

gVallverdu/pymatgen,xhqu1981/pymatgen,Bismarrck/pymatgen,Bismarrck/pymatgen,nisse3000/pymatgen,davidwaroquiers/pymatgen,fraricci/pymatgen,blondegeek/pymatgen,vorwerkc/pymatgen,ndardenne/pymatgen,davidwaroquiers/pymatgen,nisse3000/pymatgen,setten/pymatgen,xhqu1981/pymatgen,tallakahath/pymatgen,johnson1228/pymatgen,tschaume/pymatgen,Bismarrck/pymatgen,Bismarrck/pymatgen,fraricci/pymatgen,davidwaroquiers/pymatgen,richardtran415/pymatgen,blondegeek/pymatgen,nisse3000/pymatgen,vorwerkc/pymatgen,gpetretto/pymatgen,czhengsci/pymatgen,tallakahath/pymatgen,richardtran415/pymatgen,vorwerkc/pymatgen,Bismarrck/pymatgen,gmatteo/pymatgen,fraricci/pymatgen,setten/pymatgen,montoyjh/pymatgen,czhengsci/pymatgen,fraricci/pymatgen,tschaume/pymatgen,gpetretto/pymatgen,dongsenfo/pymatgen,mbkumar/pymatgen,tschaume/pymatgen,blondegeek/pymatgen,gVallverdu/pymatgen,johnson1228/pymatgen,richardtran415/pymatgen,czhengsci/pymatgen,aykol/pymatgen,tschaume/pymatgen,nisse3000/pymatgen,setten/pymatgen,matk86/pymatgen,dongsenfo/pymatgen,mbkumar/pymatgen,tschaume/pymatgen,ndardenne/pymatgen,gVallverdu/pymatgen,gpetretto/pymatgen,xhqu1981/pymatgen,johnson1228/pymatgen,montoyjh/pymatgen,dongsenfo/pymatgen,vorwerkc/pymatgen,gVallverdu/pymatgen,blondegeek/pymatgen,montoyjh/pymatgen,mbkumar/pymatgen,tallakahath/pymatgen,mbkumar/pymatgen,gpetretto/pymatgen,richardtran415/pymatgen,matk86/pymatgen,matk86/pymatgen,johnson1228/pymatgen,aykol/pymatgen,montoyjh/pymatgen,dongsenfo/pymatgen,gmatteo/pymatgen,ndardenne/pymatgen,aykol/pymatgen,davidwaroquiers/pymatgen,setten/pymatgen,matk86/pymatgen,czhengsci/pymatgen