التخوف الذي يبديه بعض القضاة هو أن تتخذ المحكمة الخاصة قوانين غير المعمول بها في المحاكم الشرعية التي تستمدها من الشريعة الإسلامية بحسب ما ينص عليه الدستور، وهو التفاف للتخلص من تلك الأحكام، واتخاذ الأحكام المتوافقة مع متطلبات المنظمات الدولية والاتفاقيات العالمية.