وشهدت العلاقات الإسرائيلية التركية في عهده سلسلة من الأزمات، منها الانتقادات التي وجهها لعملية "الرصاص المصبوب" الإسرائيلية على قطاع غزة، ثم إعلان تركيا إلغاء مشاركة إسرائيل في مناورات جوية دولية تابعة للناتو كان من المقرر أن تستضيفها في أكتوبر من عام 2009.