مازال مستقبل الرحلات الجوية التى تربط بين القاهرة والمدينة المنورة مجهولا، بسبب وجود خلافات بين سلطتى الطيران المدنى فى البلدين، خاصة بعد أن رفضت سلطة الطيران المدنى السعودى منح مصر للطيران الموافقة على تشغيل رحلتها التى تربط بين القاهرة والمدينة المنورة أمس واليوم، مما دفع سلطة الطيران المدنى المصرى إلى رفض منح الخطوط الجوية السعودية موافقة على تشغيل رحلتها من المدينة إلى القاهرة تطبيقا لمبدأ المعاملة بالمثل.